实验结束后应该对操作台面，仪器，实验用具及环境进行清洁，这对污染的控制尤为重要。
1、实验后所有的试剂按照要求进行存放，废料和废液及时清理，避免存放过多和过久，废液缸用有效氯含量为2000mg/L消毒水浸泡消除核酸污染；
2、离心管架、试管架等可重复使用的物品浸泡到500mg/L 的消毒液中过夜，第二天用清水清洗后晾干使用；
3、对各区的生物安全柜、洁净工作台先用75%酒精或者500mg/L 的消毒液擦拭后采用紫外灯进行消毒处理；
4、配制含有效氯500mg/L的消毒液对设备表面、台面、地面、物品表面、传递窗内及门窗进行擦拭，再用纯化水对设备表面、台面、进行擦拭，避免消毒液对实验器具的腐蚀，仪器如核酸提取仪采用内部紫外消毒程序进行照射；
5、操作台面使用移动紫外消毒车近距离辐照1小时，应使灯管距离工作区的距离在60-90cm；实验室内则使用室内紫外灯整晚辐照。
PCR实验室中的气溶胶污染来源于两个过程：样本制备过程和PCR扩增过程。
在样本制备过程中，样本液体面与空气摩擦就可形成气溶胶，在操作时比较剧烈地摇动反应管、开盖时、吸样时及加样器的反复吸样都可能形成气溶胶而污染；PCR扩增过程可以引起实验室中扩增产物的累积，通常一次典型的PCR扩增可以产生109拷贝的靶序列，如果气溶胶化，甚至的气溶胶都会含有106拷贝的扩增产物。
如果不加以控制，在短期内累积的气溶胶化扩增产物就会污染实验室中的试剂、仪器设备和通风系统，造成严重的实验室污染，导致检验样本出现假阳性结果，使临床做出错误的判断和决策，进而引发后续一系列的事故和恐慌。
在一般情况下，高粉尘含量会致使干净度降低，而低粉尘含量容易导致洁净度。在净化车间的建设合同中，通常只会基本的空状态测试，而因时间紧迫，经常错过静态和动态测试。但仍建议承建商和业主在静态和动态条件下都对净化车间进行测试。可有效保证净化车间的建造符合相关设计要求。在静态和动态两种不同条件下的测试结果对比，分析净化车间存在的问题，并提供有效帮助。例如：在静态条件下，洁净度达标，但到了动态条件下，却超标。
因净化车间管理措施发生失误而致使：安装机器时，不标准的清洁，不恰当的清洁程序，不严格的纪律管理，不正确的机器放置位置（将回风口挡住，或对过滤器的送风阻断）等。因此，建议在空态和动态时，都要对净化车间进行测试。
所有的净化车间测试，基本都是基于国际认可标准上。 这些标准和实践为净化工厂的测试和认证提供了基本指导。事实上，净化车间的业主和承建商因产品，工艺要求对技术指标，测试方式，验收标准有着不同协议。因此，很多验收标准由净化车间的业主和承建商通过协商，并参考净化车间测试认证公司的建议达成协议。
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